Celkovým cílem této zadávací nabídky je získat rámcovou smlouvu na posílení kapacity v oblasti genomické epidemiologie a bioinformatiky veřejného zdraví prostřednictvím interdisciplinárních školení, která jsou klíčová pro reakci během pandemie nebo neočekávaných závažných událostí v oblasti veřejného zdraví. Obecným cílem školení je podpořit země v budování jejich kapacit v oblasti genomické epidemiologie a bioinformatiky pro účely veřejného zdraví a posílit interdisciplinární spolupráci mezi bioinformatiky, epidemiology a mikrobiology v rámci země s cílem usnadnit rutinní využívání genomických informací pro dohled, připravenost a reakci na ohniska nákazy. Činnosti rovněž posílí sdílení dat a spolupráci mezi veřejnými zdravotnickými institucemi a ECDC a posílené síťové aktivity podpoří přeshraniční spolupráci. Cílovými skupinami školení jsou odborníci pracující ve veřejných zdravotnických institucích se vzděláním v oblasti výpočetní biologie a bioinformatiky a odborníci pracující ve veřejných zdravotnických institucích, kteří nemají specifické vzdělání v oblasti bioinformatiky. Cíle školení jsou: * Umožnit odborníkům se vzděláním v oblasti výpočetní biologie a bioinformatiky: - rozšířit a zdokonalit své dovednosti s cílem posílit jejich kapacity v oblasti bioinformatiky veřejného zdraví; - lépe porozumět potřebám a konceptům epidemiologie a mikrobiologie veřejného zdraví se zaměřením na vstupy a výstupy, které potřebují jejich protějšky (tj. mikrobiologové, epidemiologové, odborníci na dohled a reakci na veřejné zdraví) k rychlému a informovanému podniknutí kroků v oblasti veřejného zdraví. * Umožnit odborníkům bez vzdělání v oblasti výpočetní biologie/bioinformatiky: - lépe porozumět tomu, jak lze genomickou epidemiologii aplikovat v kontextu veřejného zdraví se zvláštním zaměřením na to, jak lze tradiční a genomická data společně analyzovat, interpretovat a používat pro účely veřejného zdraví; - lépe se seznámit s koncepty, formáty a konvencemi běžně používanými v mikrobiální genomice a lépe porozumět tomu, jak lze strukturu a formát dat použít ke zjednodušení procesu analýzy dat; - lépe porozumět konceptům a použití nejběžnějších bioinformatických nástrojů a procesů používaných pro epidemiologické analýzy, včetně limitů. Další informace na vyžádání u kontaktní osoby.

he overall objective of this tender is to procure a Framework Contract to strengthen the capacity for genomic epidemiology and public health bioinformatics through interdisciplinary trainings, which is crucial for response during a pandemic or unexpected major public health events. The general objectives of the trainings are to support countries in building up their capacity in genomic epidemiology and bioinformatics for public health purposes, and to increase the interdisciplinary collaboration between bioinformaticians, epidemiologists and microbiologists within a country to facilitate the routine use of genomic information for surveillance, preparedness, and outbreak response. Activities shall also enhance data sharing and collaborations between public health institutions and ECDC, and enhanced networking activities will foster cross-border collaborations. The target groups for the trainings are professionals working in public health institutions with a background in computational biology and bioinformatics; and professionals working in public health institutions who do not have a specific background in bioinformatics. The aims of the trainings are: * To allow the professionals with a background in computational biology and bioinformatics to: - enhance and extend their skills in order to strengthen their capacity in the field of public health bioinformatics; - better understand the needs and concepts of epidemiology and public health microbiology, with a focus on the inputs and outputs needed by their counterparts (i.e. microbiologists, epidemiologists, professionals in public health surveillance and response) to take rapid and informed public health action. * To allow the professionals without a background in computational biology/bioinformatics to: - gain a better understanding of how genomic epidemiology can be applied in a public health context with special focus on how traditional and genomic data can be jointly analysed, interpreted and used for public health purposes; - become more familiar with the concepts, formats and conventions commonly used in microbial genomics, and get a better understanding of how the structure and format of the data can be used to streamline the data analysis process; - better understand the concepts behind and use of the most common bioinformatic tools and pipelines used for epidemiological analyses, including limita. rocedure type Open procedure Estimated total value 7100000 EUR Lead contracting authority European Centre for Disease Prevention and Control Main classification (CPV) 85100000 - Health services Maximum contract duration 48 MONTH Award method best price-quality ratio Framework agreement framework agreement, without reopening of competition